RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR51A7Q8NH64 312 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CT55Q8WUE5 264 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM80Q96HE8 168 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 JMJD8Q96S16 334 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF221Q9UK13 617 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HPRP00739 348 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CNR1P21554 472 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 UPRTQ96BW1 309 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC182A6NF36 153 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 J3QLW9 94 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SOCS2O14508 198 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ST6GAL1P15907 406 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF19P17023 458 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 IVDP26440 423 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MEOX1P50221 254 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CDC20Q12834 499 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR8B8Q15620 311 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MSLNLQ96KJ4 702 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ALG12Q9BV10 488 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DUSP13Q9UII6 198 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LIPAP38571 399 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NODALQ96S42 347 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CCL21O00585 134 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OPN1SWP03999 348 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 STOMP27105 288 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 IL2RGP31785 369 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 F2RL1P55085 397 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ADGRE1Q14246 886 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 VHLLQ6RSH7 139 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KLBQ86Z14 1044 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LRFN5Q96NI6 719 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PSD2Q9BQI7 771 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 WACQ9BTA9 647 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TCFL5Q9UL49 500 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM64BA6NI03 449 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NID1P14543 1247 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CR2P20023 1033 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SRD5A2P31213 254 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PRKAR1BP31321 381 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GNB2P62879 340 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NFATC3Q12968 1075 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TLCD1Q96CP7 247 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ELP4Q96EB1 424 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 C3orf30Q96M34 536 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR7D2Q96RA2 312 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HHLA2Q9UM44 414 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 B4DXG7 233 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RAB3AP20336 220 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 EFNA3P52797 238 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1CAP62136 330 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MFAP5Q13361 173 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 E2F2Q14209 437 aa7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms