RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SLC43A2Q8N370 569 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PIGXQ8TBF5 258 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RDH12Q96NR8 316 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PKP2Q99959 881 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TIGARQ9NQ88 270 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 VDAC3Q9Y277 283 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FREM3P0C091 2139 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CACNA1GO43497 2377 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 OR14I1A6ND48 311 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 J3KTA2 159 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 OR10H3O60404 316 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ADAM11O75078 769 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SEMA7AO75326 666 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 DIRAS1O95057 198 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 AHSA1O95433 338 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 IGHG3P01860 377 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FAM87AP0C7U9 286 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SLC9A3P48764 834 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RAD23AP54725 363 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 UGT2B15P54855 530 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CTBP2P56545 445 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 NUP107P57740 925 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PRKCDQ05655 676 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TRIP10Q15642 601 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RAET1LQ5VY80 246 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SLC6A19Q695T7 634 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ARSKQ6UWY0 536 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 STK32CQ86UX6 486 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LILRA2Q8N149 483 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 OR52J3Q8NH60 311 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.43□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 SFXN2Q96NB2 322 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FUZQ9BT04 418 aa8.43□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 TEX12Q9BXU0 123 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LDAHQ9H6V9 325 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 NTN4Q9HB63 628 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RHCGQ9UBD6 479 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 MPDZO75970 2070 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 A0A087WUU8 490 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.42□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 A0A1B0GVC2 190 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PPB8 328 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRS3 328 aa8.42□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 PINLYPA6NC86 204 aa8.42□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 LYPD3O95274 346 aa8.42□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 FPR3P25089 353 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 MAGEA5P43359 124 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 HSPA13P48723 471 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
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CS-220ENST00000550700 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 SLC35A1P78382 337 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-220ENST00000550700 FOXF1Q12946 379 aa8.42□□□□□ -1.06
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