RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546804.1

AC004801.5-202, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC004801.5, Length 530 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004801.5-202ENST00000546804 CCNA2P20248 432 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 FASP25445 335 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 GCKP35557 465 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 HMGA2P52926 109 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 RAC1P63000 192 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 ATP6AP1Q15904 470 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 EXO5Q9H790 373 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 VNN3Q9NY84 501 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.9■□□□□ 0.14
AC004801.5-202ENST00000546804 SPTA1P02549 2419 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 H0YHG0 523 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 H3BML4 177 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 AQP7O14520 342 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 GADD45GO95257 159 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 LDLRP01130 860 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 LIMS1P48059 325 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 STARP49675 285 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TDGF1P3P51864 188 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 VASNQ6EMK4 673 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 C3orf33Q6P1S2 294 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 LILRA2Q8N149 483 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 OR52J3Q8NH60 311 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 SLC7A13Q8TCU3 470 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 HS6ST2Q96MM7 605 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 FUZQ9BT04 418 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 REEP1Q9H902 201 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.89■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 MED12Q93074 2177 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 A8MVM7 634 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TNFRSF11BO00300 401 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 GNGT2O14610 69 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 NPIPB7O75200 414 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 PEPDP12955 493 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 SHC1P29353 583 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 LHX2P50458 406 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 EGR4Q05215 589 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 GK3PQ14409 553 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 BCL2A1Q16548 175 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 FGD3Q5JSP0 725 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 DCST1Q5T197 706 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 GHDCQ8N2G8 530 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 STK35Q8TDR2 534 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TMEM255BQ8WV15 326 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TMEM239Q8WW34 195 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 PKP2Q99959 881 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TMEM185BQ9H7F4 350 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 NTN4Q9HB63 628 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 STOML1Q9UBI4 398 aa15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 A0A087WUU8 490 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 A0A1B0GTH9 108 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 OPN1LWP04000 364 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 UGT2B15P54855 530 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 HSF1Q00613 529 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 SEC23BQ15437 767 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 SYT14P1Q58G82 188 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 TBPL2Q6SJ96 375 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 AMIGO2Q86SJ2 522 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 GGNQ86UU5 652 aa15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
AC004801.5-202ENST00000546804 DDIT4LQ96D03 193 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms