RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCNK15Q9H427 330 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 JKAMPQ9P055 326 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIF25Q9UIL4 384 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPR160Q9UJ42 338 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RTL1A6NKG5 1358 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MED23Q9ULK4 1368 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.52□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1B0GVI7 797 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM129A0AVI4 362 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HYKKA2RU49 373 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USP17L23D6RBM5 183 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SH3BGRLO75368 114 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VSIG8P0DPA2 414 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HLA-GP17693 338 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TTPAP49638 278 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF75DP51815 510 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIRPAP78324 504 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSPB3Q12988 150 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GRIK2Q13002 908 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAM1Q15629 374 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CALCRLQ16602 461 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYP51A1Q16850 503 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDNFQ49AH0 187 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LEMD1Q68G75 181 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEX38Q6PEX7 206 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM65Q6PI78 240 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 XKRXQ6PP77 449 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STHQ8IWL8 128 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LAX1Q8IWV1 398 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FKBP10Q96AY3 582 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZG16BQ96DA0 208 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCDC120Q96HB5 630 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TXNDC15Q96J42 360 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF599Q96NL3 588 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLN8Q9UBY8 286 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CASZ1Q86V15 1759 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CPED1A4D0V7 1026 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSMB11A5LHX3 300 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00862A6NCI5 91 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FRG2CA6NGY1 282 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCE2BO14633 110 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RGS5O15539 181 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RP2O75695 350 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SC5DO75845 299 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2J2O76002 312 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RCBTB2O95199 551 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TNFAIP8O95379 198 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms