RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524955.1

CHMP4A-202, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 268 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.13□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 CACNA1GO43497 2377 aa4.13□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 A0A1B0GUH1 482 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 C7orf72A4D263 438 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC22A20A6NK97 555 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 AHRRA9YTQ3 701 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 E9PLN8 166 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SULT2B1O00204 365 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 FFAR1O14842 300 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 GSC2O15499 205 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 WDR1O75083 606 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 GMNNO75496 209 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SERPINI2O75830 405 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 AKR7A3O95154 331 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 LYPD3O95274 346 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SYNGR4O95473 234 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 CLDN1O95832 211 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 LDLRP01130 860 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 HSD17B1P14061 328 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF17P17021 662 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 BMP5P22003 454 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 EDNRAP25101 427 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC1A3P43003 542 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 DIO1P49895 249 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 MNAT1P51948 309 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 PER3P56645 1201 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 TAS2R41P59536 307 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 COPZ1P61923 177 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SELENOWP63302 87 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 VLDLRP98155 873 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 IL1RL1Q01638 556 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 EGR4Q05215 589 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SELENBP1Q13228 472 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 LAPTM4AQ15012 233 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 IFI44LQ53G44 452 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SYT14P1Q58G82 188 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 NHSL2Q5HYW2 709 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 WBP2NLQ6ICG8 309 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 C3orf33Q6P1S2 294 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 VWA1Q6PCB0 445 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 CBLL1Q75N03 491 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 GRINAQ7Z429 371 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 LUZP2Q86TE4 346 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF440Q8IYI8 595 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ELOA3Q8NG57 546 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 OR52J3Q8NH60 311 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 PFN4Q8NHR9 129 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ABHD3Q8WU67 409 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ST8SIA1Q92185 356 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 RND1Q92730 232 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 PMM1Q92871 262 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 TAAR8Q969N4 342 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC41A3Q96GZ6 507 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ADGRG7Q96K78 797 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF559Q9BR84 538 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 ADAM19Q9H013 955 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 C12orf49Q9H741 205 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 CALHM2Q9HA72 323 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 NDE1Q9NXR1 346 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 CLCF1Q9UBD9 225 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 RIMS3Q9UJD0 308 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 BAG5Q9UL15 447 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.12□□□□□ -1.75
CHMP4A-202ENST00000524955 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms