RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523177.5

NSMAF-215, Transcript of neutral sphingomyelinase activation associated factor, human

TSL 4

Gene NSMAF, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSMAF-215	ENST00000523177	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	GP6	Q9HCN6	339 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PRSS50	Q9UI38	385 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ARID1A	O14497	2285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	KRT75	O95678	551 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	RAF1	P04049	648 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	NR2F1	P10589	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	COX5A	P20674	150 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SLC7A1	P30825	629 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CTBP2	P56545	445 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	RGN	Q15493	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	MAGEB18	Q96M61	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	MED18	Q9BUE0	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	DLL4	Q9NR61	685 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	DSCAM	O60469	2012 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	FRS3	O43559	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	FZD7	O75084	574 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PMS2P2	O95744	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	YES1	P07947	543 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	THBS1	P07996	1170 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ARAF	P10398	606 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CRAT	P43155	626 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	OR3A2	P47893	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	KCNJ5	P48544	419 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	P2RY4	P51582	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CRISP3	P54108	245 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	H3F3A	P84243	136 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SELPLG	Q14242	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SQLE	Q14534	574 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ADRM1	Q16186	407 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SERPINA11	Q86U17	422 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	S100PBP	Q96BU1	408 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	RMND5A	Q9H871	391 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CFAP73	A6NFT4	308 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	CLIC1	O00299	241 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	NPIPB7	O75200	414 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PRKD3	O94806	890 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PLAU	P00749	431 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	TACR3	P29371	465 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SLC1A3	P43003	542 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SLC16A1	P53985	500 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	FADD	Q13158	208 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	PMM1	Q92871	262 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NSMAF-215	ENST00000523177	C3orf49	Q96BT1	292 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms