RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516908.1

RNU6-352P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 352, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-352P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-352P-201ENST00000516908 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NR1H2P55055 460 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CLDN15P56746 228 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 UFM1P61960 85 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CD226Q15762 336 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 DUSP5Q16690 384 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CFAP157Q5JU67 520 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 IL23RQ5VWK5 629 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ATG16L1Q676U5 607 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR4F3Q6IEY1 312 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 GFRALQ6UXV0 394 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 GGNQ86UU5 652 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 DOLPP1Q86YN1 238 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC22A9Q8IVM8 553 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC5A8Q8N695 610 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR5D16Q8NGK9 328 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TANKQ92844 425 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CDS1Q92903 461 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PGM2Q96G03 612 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 RILPQ96NA2 401 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SMC6Q96SB8 1091 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCT7Q99832 543 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SH3GL2Q99962 352 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 KLK15Q9H2R5 256 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PFDN4Q9NQP4 134 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ASB6Q9NWX5 421 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 C1orf109Q9NX04 203 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 GIN1Q9NXP7 522 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SH3BP4Q9P0V3 963 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ABI3Q9P2A4 366 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HAO1Q9UJM8 370 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SNX6Q9UNH7 406 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF835Q9Y2P0 537 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 WIF1Q9Y5W5 379 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 VPS13CQ709C8 3753 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NOTCH2Q04721 2471 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZANQ9Y493 2812 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HIVEP1P15822 2718 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 ITPR3Q14573 2671 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 C1orf226A1L170 272 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 DYTNA2CJ06 578 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 WIPF3A6NGB9 483 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CLDN24A6NM45 220 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 EFNA2O43921 213 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FADS1O60427 444 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC19A2O60779 497 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CRCPO75575 148 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CYC1P08574 325 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 FGF4P08620 206 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 STSP08842 583 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CD63P08962 238 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 SFTPCP11686 197 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PTNP21246 168 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 IL10P22301 178 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PTPN6P29350 595 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 DCTP40126 519 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CASP3P42574 277 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 CA7P43166 264 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 RFX3P48380 749 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PCP4P48539 62 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-352P-201ENST00000516908 PTH2RP49190 550 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms