RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 NTF4P34130 210 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 KHKP50053 298 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ10P78508 379 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CHRNEQ04844 493 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 DMTNQ08495 405 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CASP8Q14790 479 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 GPAT3Q53EU6 434 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 SSX8Q7RTT4 187 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 GRINAQ7Z429 371 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 DTX2Q86UW9 622 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 OR52N5Q8NH56 324 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 APH1AQ96BI3 265 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 TESCQ96BS2 214 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 NEURL3Q96EH8 262 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 SORT1Q99523 831 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CADP27708 2225 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CIB4A0PJX0 185 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 PMS2P2O95744 297 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 LBPP18428 481 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 SLC1A6P48664 564 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 HPCAP84074 193 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 PLAURQ03405 335 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 KRT71Q3SY84 523 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CCDC103Q8IW40 242 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 NUF2Q9BZD4 464 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PR80 420 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 HMGN4O00479 90 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 AP3D1O14617 1153 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 GPR171O14626 319 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 BGNP21810 368 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 S100A3P33764 101 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 ZNF83P51522 516 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 OR2B6P58173 313 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 AGAP6Q5VW22 663 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 RNF130Q86XS8 419 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 PIGXQ8TBF5 258 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 RADILQ96JH8 1075 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 ASB6Q9NWX5 421 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-211ENST00000513325 E7EQL1 145 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 E9PBE3 544 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 DNPH1O43598 174 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC16A1P53985 500 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 NME5P56597 212 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SPOCK1Q08629 439 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SYPL1Q16563 259 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 WDR93Q6P2C0 686 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A25Q6T423 547 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 ANKFN1Q8N957 763 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TEX37Q96LM6 180 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CCDC115Q96NT0 180 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 PNPOQ9NVS9 261 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 HAO1Q9UJM8 370 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.89□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CR1P17927 2039 aa14.88□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms