RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 TACR3P29371 465 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CCKARP32238 428 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CDK6Q00534 326 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ARL5BQ96KC2 179 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 MRGBPQ9NV56 204 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TMED7Q9Y3B3 224 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 C5orf58C9J3I9 102 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 SULT2B1O00204 365 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CYTIPO60759 359 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 GOSR1O95249 250 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 PMS2P2O95744 297 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TFPIP10646 304 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 UGT2B10P36537 528 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 MAP2K6P52564 334 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ADRM1Q16186 407 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 REEP3Q6NUK4 255 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF550Q7Z398 422 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TUSC5Q8IXB3 177 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 SLC35B4Q969S0 331 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CGREF1Q99674 301 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 PSD2Q9BQI7 771 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 OR11A1Q9GZK7 315 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 BCO1Q9HAY6 547 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 NDRG3Q9UGV2 375 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TESMINQ9Y4I5 508 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CSMD2Q7Z408 3487 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 POLQO75417 2590 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 C16orf97H3BN30 126 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF208O43345 1280 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TACC2O95359 2948 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 YES1P07947 543 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 PRG2P13727 222 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 KLK2P20151 261 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 KCNJ5P48544 419 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 SAR1AQ9NR31 198 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.23■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM72A0PK05 275 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 FBP2O00757 339 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 DNPH1O43598 174 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 FESP07332 822 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CCNA2P20248 432 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 PRKAR1BP31321 381 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 NFYCQ13952 458 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 BEND4Q6ZU67 534 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 SERPINA11Q86U17 422 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CDH24Q86UP0 819 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 C12orf49Q9H741 205 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TRAPPC4Q9Y296 219 aa20.22■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 SLC6A2P23975 617 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 KLF10Q13118 480 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 SCARB2Q14108 478 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 SELPLGQ14242 412 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TFAP2EQ6VUC0 442 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 STAC2Q6ZMT1 411 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 STK32CQ86UX6 486 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 KRT73Q86Y46 540 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 PTOV1Q86YD1 416 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 DDIT4LQ96D03 193 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.21■□□□□ 0.83
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF724A8MTY0 619 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 MTPNP58546 118 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 COPZ1P61923 177 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 PDK3Q15120 406 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 CADM2Q8N3J6 435 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 HIPK4Q8NE63 616 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.2■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa20.19■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FAM200B-218ENST00000512855 IMPDH2P12268 514 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms