RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 PMS2P2O95744 297 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV3-9P01782 118 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 LBPP18428 481 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 COX5AP20674 150 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 S100A3P33764 101 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC1A6P48664 564 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 OR2B6P58173 313 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 GNA13Q14344 377 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MAPK14Q16539 360 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 NRF1Q16656 503 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT71Q3SY84 523 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 OR7E24Q6IFN5 339 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC22A25Q6T423 547 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC35A5Q9BS91 424 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM109Q9BVC6 243 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC106Q9BWC9 280 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SAP130Q9H0E3 1048 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 UQCRBP14927 111 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CCNA2P20248 432 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PTAFRP25105 342 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 IDH2P48735 452 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRNEQ04844 493 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 FREM1Q5H8C1 2179 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SAXO2Q658L1 398 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC34Q8IZ02 419 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 OR52N5Q8NH56 324 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PMM1Q92871 262 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 DDIT4LQ96D03 193 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 NEURL3Q96EH8 262 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MDFIQ99750 246 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PARPBPQ9NWS1 579 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TAS2R16Q9NYV7 291 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM181Q9P2C4 612 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 UPB1Q9UBR1 384 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAPPC4Q9Y296 219 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SHISA9B4DS77 424 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TM9SF1O15321 606 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SSX4O60224 188 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SCN2BO60939 215 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAM11O75078 769 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV4-39P01824 125 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 DHRS4L1P0CG22 281 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 EDNRAP25101 427 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CASP8Q14790 479 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 FRRS1Q6ZNA5 592 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 DTX2Q86UW9 622 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRG3Q86Y34 549 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXL14Q8N1E6 418 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL5BQ96KC2 179 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 NUF2Q9BZD4 464 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 YAE1D1Q9NRH1 226 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR14LQ5THK1 2151 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF716A6NP11 495 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 E9PBE3 544 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CD8AP01732 235 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 BMP4P12644 408 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF83P51522 516 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 NUDT6P53370 316 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PHC1P78364 1004 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC35A1P78382 337 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 STX3Q13277 289 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB35Q15286 201 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CMIPQ8IY22 773 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ZG16BQ96DA0 208 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PANX1Q96RD7 426 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 DHRS9Q9BPW9 319 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CENPHQ9H3R5 247 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CBLN4Q9NTU7 201 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 BTNL2Q9UIR0 455 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 M0R1B8 84 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 NDUFS7O75251 213 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 IFNA2P01563 188 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 IL7RP16871 459 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 TTKP33981 857 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 FABP6P51161 128 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP2K6P52564 334 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms