RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM45AQ9NWC5 275 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP2-218ENST00000511185 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP2-218ENST00000511185 TMED7Q9Y3B3 224 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0G2JPF8 293 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 RAMP1O60894 148 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PGM3O95394 542 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 THBS1P07996 1170 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GNA13Q14344 377 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ADRM1Q16186 407 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD34AQ69YU3 496 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TMPPEQ6ZT21 453 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CADM2Q8N3J6 435 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 RABEP2Q9H5N1 569 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL2L10Q9HD36 194 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SERINC1Q9NRX5 453 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GLRX2Q9NS18 164 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GMEB1Q9Y692 573 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf58C9J3I9 102 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SULT2B1O00204 365 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 FAAHO00519 579 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 FBP2O00757 339 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ANGPT2O15123 496 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CYTIPO60759 359 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HRGP04196 525 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 AQP1P29972 269 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC1A3P43003 542 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 BNIP2Q12982 314 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TSC22D1Q15714 1073 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 STAC2Q6ZMT1 411 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PMM1Q92871 262 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DACH2Q96NX9 599 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 BCO1Q9HAY6 547 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ELOVL5Q9NYP7 299 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM247A6NEH6 219 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB108AA8MXU0 73 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 IMPDH2P12268 514 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GPX2P18283 190 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK6Q00534 326 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SCARB2Q14108 478 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PTOV1Q86YD1 416 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DPP10Q8N608 796 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CGREF1Q99674 301 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 MED18Q9BUE0 208 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS50Q9UI38 385 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF716A6NP11 495 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf97H3BN30 126 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TPST1O60507 370 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKD3O94806 890 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PMS2P2O95744 297 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 THBDP07204 575 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR2AP28223 471 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ARFIP2P53365 341 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 NFYCQ13952 458 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HSP90B2PQ58FF3 399 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 WFDC6Q9BQY6 131 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM19Q9H013 955 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 MED4Q9NPJ6 270 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS13CQ709C8 3753 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP2-218ENST00000511185 FXYD1O00168 92 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms