RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PRO3102	Q9H379	93 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZMAT4	Q9H898	229 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTR8	Q9H981	624 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SIAE	Q9HAT2	523 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	HHATL	Q9HCP6	504 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PNV4	684 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C5orf52	A6NGY3	159 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	EPOP	A6NHQ4	379 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971		H3BNH8	94 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CDIPT	O14735	213 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	WNT9A	O14904	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	NDUFS4	O43181	175 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RAMP3	O60896	148 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	VAMP5	O95183	116 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	NFATC1	O95644	943 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	IGSF6	O95976	241 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SERPINA1	P01009	418 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	IFNA5	P01569	189 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MT-ND1	P03886	318 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CISD3	P0C7P0	127 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF806	P0C7X5	589 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	EBLN1	P0CF75	366 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PET100	P0DJ07	73 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ARNT	P27540	789 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CD70	P32970	193 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	HTR6	P50406	440 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	IFITM2	Q01629	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MZT1	Q08AG7	82 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	HYAL1	Q12794	435 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MALL	Q13021	153 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ITIH4	Q14624	930 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4D1	Q15615	310 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBED5	Q49AG3	693 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	LPCAT4	Q643R3	524 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	REEP3	Q6NUK4	255 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SPRED1	Q7Z699	444 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ISCA2	Q86U28	154 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	COMMD2	Q86X83	199 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	EID3	Q8N140	333 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	LILRA2	Q8N149	483 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	SVOPL	Q8N434	492 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM239	Q8WW34	195 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	FGF13	Q92913	245 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ESAM	Q96AP7	390 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf159	Q96HA4	380 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF778	Q96MU6	729 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5M11	Q96RB7	305 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	LYSMD1	Q96S90	227 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR22	Q99680	433 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FBXO38-208	ENST00000504971	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		6.24	□□□□□ -1.41

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