RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 TPRP12270 2363 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PQD3 144 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 J3QRK9 145 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 WWP2O00308 870 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAM10O14672 748 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 OR7A10O76100 309 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 APOL3O95236 402 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 TIAF1O95411 115 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SAGP10523 405 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 UBL4AP11441 157 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 BMP4P12644 408 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PEPDP12955 493 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 MYL12AP19105 171 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC2A5P22732 501 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC6A6P31641 620 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXD12P35452 270 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SOX3P41225 446 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC1A3P43003 542 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC9A3P48764 834 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PNLIPRP2P54317 469 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGADQ13349 1161 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF404Q494X3 552 aa9.87□□□□□ -0.83
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SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 DESI1Q6ICB0 168 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SHFQ7M4L6 423 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 OAFQ86UD1 273 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF527Q8NB42 609 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52N1Q8NH53 320 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 OR51A7Q8NH64 312 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 MCFD2Q8NI22 146 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 FNDC8Q8TC99 324 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 STT3BQ8TCJ2 826 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 DDOQ99489 341 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 TIMP4Q99727 224 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 IFT27Q9BW83 186 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAM19Q9H013 955 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 C12orf10Q9HB07 376 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 STUB1Q9UNE7 303 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CACNA1EQ15878 2313 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ACACBO00763 2458 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM183AA6NL82 134 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ALG1L2C9J202 215 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SCDO00767 359 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF264O43296 627 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 FADS1O60427 444 aa9.86□□□□□ -0.83
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SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R3DO95685 299 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CFIP05156 583 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.86□□□□□ -0.83
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SH3BP2-209ENST00000504450 PNMTP11086 282 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 HK1P19367 917 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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SH3BP2-209ENST00000504450 CD79BP40259 229 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 COPZ1P61923 177 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PSPHP78330 225 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ISXQ2M1V0 245 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CBLN3Q6UW01 205 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 AMER2Q8N7J2 671 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-209ENST00000504450 CEP76Q8TAP6 659 aa9.86□□□□□ -0.83
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