RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.5□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.5□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 A0A1W2PQM1 296 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CPED1A4D0V7 1026 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 TO15178 435 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 LAMTOR5O43504 91 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 UBL4AP11441 157 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CPEP16870 476 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 LCN1P31025 176 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CCL7P80098 99 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ACY1Q03154 408 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SKP2Q13309 424 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CD226Q15762 336 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ZNF404Q494X3 552 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PHC2Q8IXK0 858 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 FNDC8Q8TC99 324 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PIGKQ92643 395 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 IFT27Q9BW83 186 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 TGIF2Q9GZN2 237 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CTSFQ9UBX1 484 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 STUB1Q9UNE7 303 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.49□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 A0A087WUJ7 227 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CCDC182A6NF36 153 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 OR6C76A6NM76 312 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 J3QRE1 110 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SCDO00767 359 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PPP1R3DO95685 299 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SLC6A6P31641 620 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CD79BP40259 229 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SLC1A3P43003 542 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CRYBB2P43320 205 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 NSDHLQ15738 373 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 C16orf87Q6PH81 154 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 AMER2Q8N7J2 671 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 GATSQ8NAP1 163 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 TM9SF4Q92544 642 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 EDAQ92838 391 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SGTBQ96EQ0 304 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ZNF649Q9BS31 505 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 MMP27Q9H306 513 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 FAM183AA6NL82 134 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 WWP2O00308 870 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 GNB5O14775 395 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 TSPAN2O60636 221 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ICOSLGO75144 302 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PPM1BO75688 479 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SLC9A3P48764 834 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 COPZ1P61923 177 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 TMED1Q13445 227 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 TPBGQ13641 420 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 APOOLQ6UXV4 268 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 OAFQ86UD1 273 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 PRR22Q8IZ63 422 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.48□□□□□ -0.89
TNS1-217ENST00000490566 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms