RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 CCDC182A6NF36 153 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 F5H6K3 240 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 SH3BGRLO75368 114 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 ATP5LO75964 103 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 RENP00797 406 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 CSTAP01040 98 aa3.93□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 RNH1P13489 461 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 RAB9AP51151 201 aa3.93□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 VTCN1Q7Z7D3 282 aa3.93□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.93□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 C19orf60Q96EN9 201 aa3.93□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 RGCCQ9H4X1 137 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 NT5MQ9NPB1 228 aa3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.93□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 AP2A1O95782 977 aa3.92□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 STOX1Q6ZVD7 989 aa3.92□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 ELMO1Q92556 727 aa3.92□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 STARD10Q9Y365 291 aa3.92□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.91□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
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CCL20-204ENST00000489160 FCN1O00602 326 aa3.91□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 RS1O15537 224 aa3.91□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 HPP00738 406 aa3.91□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 NPPAP01160 153 aa3.91□□□□□ -1.78
CCL20-204ENST00000489160 MBP02144 154 aa3.91□□□□□ -1.78
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