RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 METTL6Q8TCB7 284 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 AGR3Q8TD06 166 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SMPDL3AQ92484 453 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 UBE2E3Q969T4 207 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NSL1Q96IY1 281 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 OR4K3Q96R72 315 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 TRIM2Q9C040 744 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NT5DC2Q9H857 520 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ACTR8Q9H981 624 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 AIG1Q9NVV5 245 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF69Q9UC07 566 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 MANBAO00462 879 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RAMP1O60894 148 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 TRAPPC6AO75865 159 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CCNDBP1O95273 360 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NPPAP01160 153 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PPP3CBP16298 524 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 IL1RNP18510 177 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CD22P20273 847 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 JAK1P23458 1154 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 OMGP23515 440 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 GDF5P43026 501 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 EFNA4P52798 201 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 CDH15P55291 814 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SIRPAP78324 504 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 PHEXP78562 749 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ABATP80404 500 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 IRF8Q02556 426 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KLF10Q13118 480 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NAE1Q13564 534 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 AGAP6Q5VW22 663 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 FRG2Q64ET8 278 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 TTLQ8NG68 377 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ESAMQ96AP7 390 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KLHL29Q96CT2 875 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 C3orf30Q96M34 536 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 FRG2BQ96QU4 278 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 KCNA7Q96RP8 456 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 TBX15Q96SF7 602 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 MRI1Q9BV20 369 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.66□□□□□ -1.34
TRDMT1-210ENST00000488990 A0A1W2PPV9 198 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 OR2A25A4D2G3 310 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 H0Y3Z8 333 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 NDUFS8O00217 210 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 ANKRD28O15084 1053 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 RDH16O75452 317 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 SEMA3DO95025 777 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 TGM6O95932 706 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 PRPS2P11908 318 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 COX4I1P13073 169 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 TSPAN8P19075 237 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 GPX3P22352 226 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 PIK3R1P27986 724 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 GSTM5P46439 218 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 HTR6P50406 440 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 SRYQ05066 204 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 STX5Q13190 355 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 CHIT1Q13231 466 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 DOC2AQ14183 400 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 KIAA0040Q15053 153 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 NRN1LQ496H8 165 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.65□□□□□ -1.35
TRDMT1-210ENST00000488990 SPIN4Q56A73 249 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms