RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474831.5

LAMTOR4-208, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-208	ENST00000474831	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KRT73	Q86Y46	540 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ABHD3	Q8WU67	409 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WNT2B	Q93097	391 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF607	Q96SK3	696 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831		A0A1W2PNV4	684 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LINC01387	J3KSC0	135 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAAH	O00519	579 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RCBTB2	O95199	551 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LGI1	O95970	557 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FES	P07332	822 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ME2	P23368	584 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TIMP3	P35625	211 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CPOX	P36551	454 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR1E2	P47887	323 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CARD18	P57730	90 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MYBPH	Q13203	477 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GUSBP1	Q15486	140 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MTFR2	Q6P444	385 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF550	Q7Z398	422 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM234	Q8WY98	164 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DOCK7	Q96N67	2140 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SH3GL1	Q99961	368 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ALG2	Q9H553	416 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RNF122	Q9H9V4	155 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ADA2	Q9NZK5	511 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CXCR6	O00574	342 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UBOX5	O94941	541 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IL2RA	P01589	272 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC7A1	P30825	629 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KDELR2	P33947	212 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DIO1	P49895	249 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EGR4	Q05215	589 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CEACAM7	Q14002	265 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KRT72	Q14CN4	511 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR1Q1	Q15612	314 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	XKRX	Q6PP77	449 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LUZP2	Q86TE4	346 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CARM1	Q86X55	608 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCDC103	Q8IW40	242 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HHATL	Q9HCP6	504 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF175	Q9Y473	711 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MED12L	Q86YW9	2145 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HSPB2	A8KAH6	182 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LRRN3	E7EW58	273 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SERPINB7	O75635	380 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CTSS	P25774	331 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CDH12	P55289	794 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR2B6	P58173	313 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	VEZF1	Q14119	521 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HSPB2	Q16082	182 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		12.43	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms