RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473542.1

BBX-223, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 3

Gene BBX, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-223	ENST00000473542	PTGDS	P41222	190 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	BTD	P43251	543 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NOV	P48745	357 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ASPH	Q12797	758 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CUL1	Q13616	776 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ARL6IP1	Q15041	203 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	EOGT	Q5NDL2	527 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NPY6R	Q99463	290 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MEMO1	Q9Y316	297 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SNTN	A6NMZ2	147 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	IDS	B3KWA1	339 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NBR2	O15453	112 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	FCMR	O60667	390 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	B4GALT2	O60909	372 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CCDC130	P13994	396 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	GCA	P28676	217 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	UGT1A5	P35504	534 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ATL3	Q6DD88	541 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RUFY3	Q7L099	469 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ARC	Q7LC44	396 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OR2L13	Q8N349	312 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NEIL2	Q969S2	332 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	UBE2E3	Q969T4	207 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SEC22A	Q96IW7	307 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	B3GALT6	Q96L58	329 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	VCPKMT	Q9H867	229 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SGK2	Q9HBY8	427 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	COPS3	Q9UNS2	423 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TNR	Q92752	1358 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PFKFB2	O60825	505 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RAMP3	O60896	148 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CLDN9	O95484	217 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TSPAN12	O95859	305 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CCDC166	P0CW27	439 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ANXA13	P27216	316 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RFC4	P35249	363 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	EPS15	P42566	896 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RGR	P47804	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ZNF45	Q02386	682 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ZMYND11	Q15326	602 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OR56B4	Q8NH76	319 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NT5C3B	Q969T7	300 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	COPS8	Q99627	209 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CNPY3	Q9BT09	278 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542		E7ENQ6	273 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542		H0Y8G0	127 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OR8U8	P0C7N1	319 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PCMT1	P22061	227 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CALCR	P30988	508 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MAGEA8	P43361	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SULT1E1	P49888	294 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	DIO3	P55073	304 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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