RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX19Q8NA77 164 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC01555Q8NAE3 123 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 MRGPRX3Q96LB0 322 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 HS6ST2Q96MM7 605 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ABRACLQ9P1F3 81 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PPV9 198 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 LRIT2A6NDA9 550 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SELENOFO60613 162 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2A4O95047 310 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SPTBP11277 2137 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CCR2P41597 374 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CSNK1G2P78368 415 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 MAPK14Q16539 360 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TMUB2Q71RG4 321 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 GJD3Q8N144 294 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2L2Q8NH16 312 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC25A38Q96DW6 304 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2A7Q96R45 310 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD19PQ9H560 264 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD61A6NGH8 418 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 IDSB3KWA1 339 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 NT5EP21589 574 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 HTR2AP28223 471 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 S100A11P31949 105 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PRR5P85299 388 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB33AQ14088 237 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF613Q6PF04 617 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 FRRS1Q6ZNA5 592 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 OR56A1Q8NGH5 318 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 OR1S1Q8NH92 325 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 NR4A3Q92570 626 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 NPAS1Q99742 590 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS27Q9BQR3 290 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 FN3KQ9H479 309 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PELI2Q9HAT8 420 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHA1Q9HB21 404 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 WASH6PQ9NQA3 447 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 OBSL1O75147 1896 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM86C2PA6NEL3 165 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC22A31A6NKX4 558 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BSH0 61 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCD4O14678 606 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 STX11O75558 287 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ITGA10O75578 1167 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PAPLNO95428 1278 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 C6P13671 934 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF35P13682 527 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 BCL6P41182 706 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CBX5P45973 191 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 H2BFSP57053 126 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 RAP2BP61225 183 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFA5Q01523 94 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2NLQ5JXB2 153 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ELFN2Q5R3F8 820 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM74A1Q5RGS3 127 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CACUL1Q86Y37 369 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 NAXDQ8IW45 347 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ACOT4Q8N9L9 421 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CLRN3Q8NCR9 226 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAMTS15Q8TE58 950 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 THEM6Q8WUY1 208 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ELP4Q96EB1 424 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TCEAL4Q96EI5 215 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PELI1Q96FA3 418 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 GFI1Q99684 422 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF559Q9BR84 538 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR174Q9BXC1 333 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SYNPO2LQ9H987 977 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 NOX4Q9NPH5 578 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CLDND1Q9NY35 253 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CPNE7Q9UBL6 633 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 KLF15Q9UIH9 416 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ATPIF1Q9UII2 106 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 GNG8Q9UK08 70 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 WNT6Q9Y6F9 365 aa12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms