RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 AKAP9Q99996 3911 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 TMEM247A6NEH6 219 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 CFAP73A6NFT4 308 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 ZNF814B7Z6K7 855 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 ZNF208O43345 1280 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 MVDP53602 400 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 CRISP3P54108 245 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 DSTNP60981 165 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 PLAURQ03405 335 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 SSX8Q7RTT4 187 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 GALNT5Q7Z7M9 940 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 PIGXQ8TBF5 258 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 DDIT4LQ96D03 193 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 PLPPR2Q96GM1 343 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 SLC6A13Q9NSD5 602 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-205ENST00000467594 ABCA4P78363 2273 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 DSPPQ9NZW4 1301 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 AP3D1O14617 1153 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 GPR171O14626 319 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TMCC2O75069 709 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 ADAM11O75078 769 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TFPTP0C1Z6 253 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 ETFAP13804 333 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 SLC1A3P43003 542 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 LIN52Q52LA3 116 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 P3H2Q8IVL5 708 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 ZNF100Q8IYN0 542 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 OR52P1PQ8NH57 321 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 SLC38A5Q8WUX1 472 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 VPS33AQ96AX1 596 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 ARL5BQ96KC2 179 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TMEM204Q9BSN7 226 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 CCDC28BQ9BUN5 200 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 POTEKPQ9BYX7 375 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 RAD21L1Q9H4I0 556 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 ARMC7Q9H6L4 198 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TCF7L2Q9NQB0 619 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 DLL4Q9NR61 685 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 OSGIN1Q9UJX0 560 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 ZNF232Q9UNY5 417 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TMED7Q9Y3B3 224 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 AKAP6Q13023 2319 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 A0A0G2JPF8 293 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 CDHR4A6H8M9 788 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 BCHEP06276 602 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 THBS1P07996 1170 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TACR3P29371 465 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 OR2B6P58173 313 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 SLC35A1P78382 337 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 EPS8Q12929 822 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 MAPK11Q15759 364 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 PRSS57Q6UWY2 283 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 GTF2H4Q92759 462 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TMEM45AQ9NWC5 275 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 PRSS50Q9UI38 385 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 CLIC1O00299 241 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 HS3ST1O14792 307 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 CCNA2P20248 432 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 IDH3AP50213 366 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 SLC16A1P53985 500 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 COPZ1P61923 177 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 FADDQ13158 208 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 RGNQ15493 299 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TSC22D1Q15714 1073 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 TAB1Q15750 504 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 GTDC1Q4AE62 458 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-205ENST00000467594 RNF220Q5VTB9 566 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms