RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	NCF4	Q15080	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CAMK4	Q16566	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	C3AR1	Q16581	482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	HFE	Q30201	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080		Q9H8V8	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CRCP	O75575	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	RAD51D	O75771	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PALM	O75781	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	NXPH2	O95156	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	JCHAIN	P01591	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IRF2	P14316	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CA7	P43166	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SYK	P43405	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	NPBWR1	P48145	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	STC1	P52823	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	FOLH1	Q04609	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	KLC1	Q07866	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CEBPE	Q15744	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SGCB	Q16585	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PHKG1	Q16816	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080		Q6ZRP5	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	VGLL1	Q99990	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MPDZ	O75970	2070 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PSMD11	O00231	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	DFFA	O00273	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CTDSPL	O15194	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	VEGFD	O43915	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CRLF1	O75462	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	GLCE	O94923	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	PVR	P15151	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	CMA1	P23946	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM17-208	ENST00000467080	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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