RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461520.5

USP54-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP54, Length 1,212 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-208ENST00000461520 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 KIAA0040Q15053 153 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 RAET1LQ5VY80 246 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 TDRPQ86YL5 185 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 OR2M3Q8NG83 312 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 POC1BQ8TC44 478 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 PIGQQ9BRB3 760 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 HHATLQ9HCP6 504 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 MED11Q9P086 117 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 OR2M5A3KFT3 312 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 LINC00473A8K010 186 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ZNF785A8K8V0 405 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 C17orf51A8MQB3 221 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 SLC28A1O00337 649 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 EMC8O43402 210 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 RGS14O43566 566 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 TBX19O60806 448 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 SEC22BO75396 215 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 NKX2-2O95096 273 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ANGPTL1O95841 491 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 PRPS2P11908 318 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 NEFHP12036 1026 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CPA3P15088 417 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CPOXP36551 454 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 MAP3K8P41279 467 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CLDN15P56746 228 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 FGFBP1Q14512 234 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 LIPMQ5VYY2 423 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 MARCH3Q86UD3 253 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CCDC63Q8NA47 563 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 STARD4Q96DR4 205 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 PGM2Q96G03 612 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 EGLN2Q96KS0 407 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 FCRL1Q96LA6 429 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 TRMOQ9BU70 441 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 PINK1Q9BXM7 581 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 RNF122Q9H9V4 155 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 C1orf109Q9NX04 203 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 MID2Q9UJV3 735 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ZNF175Q9Y473 711 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 FREM3P0C091 2139 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 A0A087WZY1 265 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 A0A1W2PPR1 153 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ALG1L2C9J202 215 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 F5H697 171 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 H3BML4 177 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 COPEO14579 308 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 AZIN1O14977 448 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 SEC14L5O43304 696 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 UTS2O95399 124 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CHEK2O96017 543 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CGAP01215 116 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 SHBGP04278 402 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 NGFRP08138 427 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 FCGR2AP12318 317 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 POU2F1P14859 743 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 ZNF17P17021 662 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CD53P19397 219 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 LCN1P31025 176 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 GABRA3P34903 492 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-208ENST00000461520 CD79BP40259 229 aa6.49□□□□□ -1.37
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