RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409648.8

SLC35E1-201, Transcript of solute carrier family 35 member E1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC35E1, Length 3,691 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1-201ENST00000409648 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LRR1Q96L50 414 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 OR4K3Q96R72 315 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 REEP4Q9H6H4 257 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 CWH43Q9H720 699 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SGK2Q9HBY8 427 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 TMEM129A0AVI4 362 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 H0YIV9 168 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 GPR31O00270 319 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SULT1C2O00338 296 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 DVL2O14641 736 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 CIDEAO60543 219 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 NR2F6P10588 404 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 EPCAMP16422 314 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SPI1P17947 270 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 RAB1AP62820 205 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 RNF4P78317 190 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 EFNB1P98172 346 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 Q6ZVU0 165 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 NR4A3Q92570 626 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 KAT2AQ92830 837 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 DDOQ99489 341 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 PHF11Q9UIL8 331 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 TBX21Q9UL17 535 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 RFXAPO00287 272 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LEFTY2O00292 366 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 FAAHO00519 579 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 KLHL18O94889 574 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LIMS3P0CW19 117 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LIMS4P0CW20 117 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 MPC1LP0DKB6 136 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LCN1P31025 176 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 TSPAN5P62079 268 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 RPS13P62277 151 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ST3GAL2Q16842 350 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 KLHL26Q53HC5 615 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 Q5PR19 223 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 TMEM25Q86YD3 366 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 BEST4Q8NFU0 473 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 PFDN5Q99471 154 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 TRIM2Q9C040 744 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 GAREM1Q9H706 876 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 A0A1B0GVI7 797 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 GABRPO00591 440 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LILRB5O75023 590 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SDC3O75056 442 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 FURINP09958 794 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 MST1P26927 711 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 ECI1P42126 302 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 LSSP48449 732 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 GAREM2Q75VX8 874 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 SPRED2Q7Z698 418 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 FIBINQ8TAL6 211 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 RNFT2Q96EX2 444 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 NPTNQ9Y639 398 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC35E1-201ENST00000409648 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.28□□□□□ -1.24
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