RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 H3BN98 237 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 M0R129 80 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 BHLHE40O14503 412 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CDC42EP2O14613 210 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 PRKYO43930 277 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 PIP5K1CO60331 668 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 FADS1O60427 444 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ENTPD6O75354 484 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 RFPL3O75679 317 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 INMTO95050 263 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NADKO95544 446 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 HEXBP07686 556 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ADRA2AP08913 450 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF806P0C7X5 589 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CCL4P13236 92 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NAGAP17050 411 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 MAKP20794 623 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 POU1F1P28069 291 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 GSTT1P30711 240 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 GRK5P34947 590 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 LIMK1P53667 647 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 EMP2P54851 167 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 RNF4P78317 190 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 LSAMPQ13449 338 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NCF4Q15080 339 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CD226Q15762 336 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NEDD8Q15843 81 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NNATQ16517 81 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 LPAL2Q16609 132 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 PHF19Q5T6S3 580 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 AADACL4Q5VUY2 407 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 FAM198BQ6UWH4 519 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CASP12Q6UXS9 341 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 RRM2BQ7LG56 351 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF527Q8NB42 609 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 OR4Q3Q8NH05 313 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TEX47Q8TBZ9 253 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM163Q8TC26 289 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 FCGR1BQ92637 280 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 C3orf49Q96BT1 292 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ISOC1Q96CN7 298 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 YIPF6Q96EC8 236 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ARSGQ96EG1 525 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 COPS4Q9BT78 406 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SPRY4Q9C004 299 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 DSN1Q9H410 356 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 CNIH4Q9P003 139 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 MED31Q9Y3C7 131 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 NINQ8N4C6 2090 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 BDP1A6H8Y1 2624 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SCN2AQ99250 2005 aa5.5□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 USP34Q70CQ2 3546 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 UNC119BA6NIH7 251 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 H3BMQ9 156 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SCDO00767 359 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 SURF4O15260 269 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF264O43296 627 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 ICOSLGO75144 302 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 GABARAPO95166 117 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 RCBTB2O95199 551 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 HMGN1P05114 100 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 STSP08842 583 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 TSPAN19P0C672 248 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 UBL4AP11441 157 aa5.49□□□□□ -1.53
C6orf48-208ENST00000395788 IFI30P13284 250 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms