RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 ING4Q9UNL4 249 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ENTPD4Q9Y227 616 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 GPX1P07203 203 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ERGP11308 486 aa-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 F2RP25116 425 aa-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 ADRA1AP35348 466 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 AKR1D1P51857 326 aa-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 CASP9P55211 416 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 IL1RL1Q01638 556 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TSPAN31Q12999 210 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 IL18R1Q13478 541 aa-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 DPCR1Q3MIW9 517 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 KLHL15Q96M94 604 aa-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 MED14O60244 1454 aa-1.5□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 PP2D1A8MPX8 630 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 LEUTXA8MZ59 168 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 CCSO14618 274 aa-1.51□□□□□ -2.65
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RNU6-540P-201ENST00000384622 CD5LO43866 347 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 VAMP5O95183 116 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 REG1AP05451 166 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 ADRB2P07550 413 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 FEN1P39748 380 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TDO2P48775 406 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 TGM4P49221 684 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-540P-201ENST00000384622 NUMBP49757 651 aa-1.51□□□□□ -2.65
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