RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM246Q9BRR3 403 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CDCP1Q9H5V8 836 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 NUMA1Q14980 2115 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 MT-ND4P03905 459 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 OR8G3PP0DMU2 310 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CA5AP35218 305 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 OLAHQ9NV23 265 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 PIP5K1CO60331 668 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 IL7P13232 177 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 KEAP1Q14145 624 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SIRT6Q8N6T7 355 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM163Q8TC26 289 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 FAM53CQ9NYF3 392 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TNFSF4P23510 183 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SLC14A2Q15849 920 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TAZQ16635 292 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 OR8J2Q8NGG1 315 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SLC37A2Q8TED4 501 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SEMA6CQ9H3T2 930 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TAS2R16Q9NYV7 291 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ATG4BQ9Y4P1 393 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 MYO10Q9HD67 2058 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 FAM166BA8MTA8 275 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CRHBPP24387 322 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ACTBP60709 375 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ACTG1P63261 375 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 GOLM1Q8NBJ4 401 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 OR1S1Q8NH92 325 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM255BQ8WV15 326 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TM4SF18Q96CE8 201 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ANKRD60Q9BZ19 345 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TBC1D29Q9UFV1 150 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 POM121BA6NF01 834 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 RAB3DO95716 219 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 OR8U9P0C7N5 309 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 REEP5Q00765 189 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 OR5D14Q8NGL3 314 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CCL4L1Q8NHW4 92 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CHPT1Q8WUD6 406 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TUBB1Q9H4B7 451 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ACKR4Q9NPB9 350 aa12□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ALS2Q96Q42 1657 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 H3BMQ9 156 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 PTPN6P29350 595 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 OPRL1P41146 370 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CAMLGP49069 296 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CLDN12P56749 244 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 GPR85P60893 370 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 TGFBR3Q03167 851 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 DCUN1D4Q92564 292 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 COG8Q96MW5 612 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 BIRC8Q96P09 236 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 RGCCQ9H4X1 137 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ARNTLO00327 626 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 PFN3P60673 137 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 GORASP2Q9H8Y8 452 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 A0A0U1RQK1 487 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 HCRTR1O43613 425 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SLC43A1O75387 559 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 GPR155Q7Z3F1 870 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 IFI44Q8TCB0 444 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ARL5BQ96KC2 179 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 MS4A8Q9BY19 250 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 RASD1Q9Y272 281 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 FURINP09958 794 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 BIDP55957 195 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ERVK-16P61578 105 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 RBPJQ06330 500 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SBSNQ6UWP8 590 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 AAED1Q7RTV5 226 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 SIMC1Q8NDZ2 872 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF566Q969W8 418 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms