RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC1A3P43003 542 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 GUCY1A3Q02108 690 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 ZSWIM7Q19AV6 140 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 GCNT6Q5T4J0 391 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 BBS10Q8TAM1 723 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 TSPEARQ8WU66 669 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 ARL5BQ96KC2 179 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 C12orf49Q9H741 205 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 IFT52Q9Y366 437 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 TMED7Q9Y3B3 224 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 EVPLLA8MZ36 301 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 C5orf58C9J3I9 102 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 C16orf97H3BN30 126 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 SULT2B1O00204 365 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 ANGPT2O15123 496 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 CCNA2P20248 432 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 TACR3P29371 465 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 CGB2Q6NT52 195 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 RETREG3Q86VR2 466 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 DPP10Q8N608 796 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 NRGNQ92686 78 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 PSD2Q9BQI7 771 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP5-201ENST00000366391 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 CYTIPO60759 359 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 GOSR1O95249 250 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 PMS2P2O95744 297 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 FESP07332 822 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 YES1P07947 543 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ETS2P15036 469 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ARFIP2P53365 341 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 CDK6Q00534 326 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 BEND4Q6ZU67 534 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF550Q7Z398 422 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 STK32CQ86UX6 486 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 CDC20BQ86Y33 519 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 LURAP1LQ8IV03 231 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAM19Q9H013 955 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 BCO1Q9HAY6 547 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 CADP27708 2225 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM72A0PK05 275 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 CASKO14936 926 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF208O43345 1280 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 PRG2P13727 222 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 REEP3Q6NUK4 255 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 SERPINA11Q86U17 422 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 CADM2Q8N3J6 435 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 CGREF1Q99674 301 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 MED18Q9BUE0 208 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 FANCFQ9NPI8 374 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 F8P00451 2351 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 AKAP9Q99996 3911 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP8B1O43520 1251 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 DNPH1O43598 174 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 HRGP04196 525 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 MAP2K6P52564 334 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 COPZ1P61923 177 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 NFYCQ13952 458 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 SCARB2Q14108 478 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP5-201ENST00000366391 POU4F3Q15319 338 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms