RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365563.1

RNU6-54P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 54, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-54P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-54P-201ENST00000365563 ANKRD46Q86W74 232 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TTC39CQ8N584 583 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR4F15Q8NGB8 312 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 MUC7Q8TAX7 377 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 EXT2Q93063 718 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ULK4Q96C45 1275 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TM4SF18Q96CE8 201 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 EVI5LQ96CN4 794 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 IP6K3Q96PC2 410 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TSPAN18Q96SJ8 248 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 INPP5KQ9BT40 448 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 C1orf198Q9H425 327 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 SYNCQ9H7C4 482 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 YY1AP1Q9H869 796 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 SIAEQ9HAT2 523 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF286AQ9HBT8 521 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 RAB9BQ9NP90 201 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 MIS18AQ9NYP9 233 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 RRN3Q9NYV6 651 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 MTCH1Q9NZJ7 389 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 GALPQ9UBC7 116 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TAGLN3Q9UI15 199 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CDH7Q9ULB5 785 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CUL9Q8IWT3 2517 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 STRCP1A6NGW2 1772 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 PASKQ96RG2 1323 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 PLXNA3P51805 1871 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CREBBPQ92793 2442 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TNS2Q63HR2 1409 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF292O60281 2723 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 MYO9BQ13459 2157 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ILVBLA1L0T0 632 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF716A6NP11 495 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 H0YHG0 523 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 BPY2O14599 106 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 AGPAT2O15120 278 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC31A2O15432 143 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 MBTPS2O43462 519 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 JAK2O60674 1132 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ECI2O75521 394 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 OLFM2O95897 454 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 APCSP02743 223 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 BGLAPP02818 100 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 IGLV7-43P04211 117 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 PRPS2P11908 318 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 GZMAP12544 262 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TCF4P15884 667 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF30P17039 623 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 GZMHP20718 246 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 GCH1P30793 250 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 FMO3P31513 532 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CASP14P31944 242 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 MPV17P39210 176 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 GALR1P47211 349 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR3A1P47881 315 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 RAB28P51157 221 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCL23P55773 120 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 DLX1P56177 255 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 STARD6P59095 220 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ARG2P78540 354 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TSPY1Q01534 308 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TGFBR3Q03167 851 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ARL6IP1Q15041 203 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CYBRD1Q53TN4 286 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 KCTD16Q68DU8 428 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF470Q6ECI4 717 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 C11orf71Q6IPW1 123 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CREBRFQ8IUR6 639 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 BPIFB2Q8N4F0 458 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR4F17Q8NGA8 305 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR10G3Q8NGC4 313 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR9G1Q8NH87 305 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 COQ8AQ8NI60 647 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 BRSK1Q8TDC3 778 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 DNAJC19Q96DA6 116 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 PGLYRP4Q96LB8 373 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 C12orf42Q96LP6 360 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 OR4F4Q96R69 305 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 SORT1Q99523 831 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-54P-201ENST00000365563 CHAC1Q9BUX1 264 aa-0.63□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms