RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 IFT46Q9NQC8 304 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 TVP23BQ9NYZ1 205 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SERTAD3Q9UJW9 196 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SSX5O60225 188 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 GABARAPO95166 117 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 AGR2O95994 175 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 STSP08842 583 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DAB2P98082 770 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 LCN10Q6JVE6 187 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 CDH26Q8IXH8 852 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 MCFD2Q8NI22 146 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 FAR1Q8WVX9 515 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 PPA2Q9H2U2 334 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.64□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 A0A1B0GX78 115 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 LINC00587B1AMM8 73 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 PRAMEF2O60811 474 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 GCGRP47871 477 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 NCS1P62166 190 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 FUT7Q11130 342 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 FAPQ12884 760 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DSG2Q14126 1118 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 OR1Q1Q15612 314 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 COX15Q7KZN9 410 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 BCORP1Q8N888 145 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DTWD2Q8NBA8 298 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SLC38A4Q969I6 547 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 MUL1Q969V5 352 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 HDHD5Q9BXW7 423 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DUSP21Q9H596 190 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 MGAT4BQ9UQ53 548 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 OR6C70A6NIJ9 312 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 PRKYO43930 277 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ENTPD6O75354 484 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 RFPL3O75679 317 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DBIP07108 87 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SLC37A1P57057 533 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ST3GAL3Q11203 375 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 RIN1Q13671 783 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 EFR3AQ14156 821 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SLC30A6Q6NXT4 461 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SLC2A12Q8TD20 617 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 GGHQ92820 318 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ZNF566Q969W8 418 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 COPS4Q9BT78 406 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SCN3BQ9NY72 215 aa11.63□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ARRDC5A6NEK1 342 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SELLP14151 372 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 PSMB9P28065 219 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 TGFBR1P36897 503 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 OMPP47874 163 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DEFA1P59665 94 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DEFA3P59666 94 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 CDC42P60953 191 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 GINS1Q14691 196 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 TRAM2Q15035 370 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 MED25Q71SY5 747 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 RRM2BQ7LG56 351 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SGK3Q96BR1 496 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ZNF524Q96C55 264 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 DPH1Q9BZG8 443 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 RTN4RQ9BZR6 473 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 Q9N2J8 555 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 CBLCQ9ULV8 474 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 SDK2Q58EX2 2172 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.62□□□□□ -0.55
GGPS1-202ENST00000358966 OIP5O43482 229 aa11.62□□□□□ -0.55
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