RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356537.8

CCDC25-201, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC25, Length 3,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-201ENST00000356537 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.66□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 RFKQ969G6 155 aa8.66□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.66□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.66□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 A0A087WV48 116 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 A0A1W2PQM1 296 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 PRR32B1ATL7 298 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 IL33O95760 270 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 HMGN1P05114 100 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 RANBP1P43487 201 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 DSG2Q14126 1118 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 BAK1Q16611 211 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 OR52N1Q8NH53 320 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 SLC35B4Q969S0 331 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 TRIM2Q9C040 744 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 FRYQ5TBA9 3013 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 TECTAO75443 2155 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 PPICP45877 212 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 GUSBP11Q6P575 273 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 ART5Q96L15 291 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 OR1F2PQ96R84 312 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 NPAS1Q99742 590 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 ALG8Q9BVK2 526 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 RNF32Q9H0A6 362 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.65□□□□□ -1.02
CCDC25-201ENST00000356537 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SLC35F4A4IF30 521 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 EFCAB7A8K855 629 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 GABRPO00591 440 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 CBFA2T3O75081 653 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 RCBTB2O95199 551 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 UTS2O95399 124 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 IL1AP01583 271 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TSPAN19P0C672 248 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PEPDP12955 493 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ADH7P40394 386 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF45Q02386 682 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SERTAD2Q14140 314 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 GALEQ14376 348 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TRIM16LQ309B1 348 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 KLHL12Q53G59 568 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 CMIPQ8IY22 773 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 GHDCQ8N2G8 530 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR7G1Q8NGA0 311 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 UFD1Q92890 307 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SHDQ96IW2 340 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ADOQ96SZ5 270 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 NUAK2Q9H093 628 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ABCB9Q9NP78 766 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SSR3Q9UNL2 185 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.65□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR6C68A6NDL8 312 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 CD8B2A6NJW9 211 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 GMFGO60234 142 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SBK2P0C263 348 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 CD8BP10966 210 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF117Q03924 483 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 LCN10Q6JVE6 187 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR5J2Q8NH18 312 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR4K13Q8NH42 304 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms