RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa25.08■■□□□ 1.61
GIPC1-201ENST00000345425 AP4B1Q9Y6B7 739 aa25.08■■□□□ 1.61
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GVC2 190 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 H3BNX3 289 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 CLOCKO15516 846 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF208O43345 1280 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 NHSL2Q5HYW2 709 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 FGD3Q5JSP0 725 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00114Q6XXX2 140 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 HS6ST2Q96MM7 605 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS27Q9BQR3 290 aa25.08■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 LDLRP01130 860 aa25.07■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 GK3PQ14409 553 aa25.07■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 NKAIN4Q8IVV8 208 aa25.07■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 LILRA2Q8N149 483 aa25.07■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 GHDCQ8N2G8 530 aa25.07■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 OR52J3Q8NH60 311 aa25.07■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 DDIT4LQ96D03 193 aa25.07■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 ASF1BQ9NVP2 202 aa25.07■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 TMEM72A0PK05 275 aa25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 GJE1A6NN92 205 aa25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 EFNA2O43921 213 aa25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 ATP6AP1Q15904 470 aa25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa25.06■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 WDR88Q6ZMY6 472 aa25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNF426Q9BUY5 554 aa25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF407Q9C0G0 2248 aa25.06■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 A8MVM7 634 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 TNFRSF11BO00300 401 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 AQP7O14520 342 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 PEPDP12955 493 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 BMP7P18075 431 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 SYT14P1Q58G82 188 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 LRTOMTQ8WZ04 291 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 SLX1AQ9BQ83 275 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 BDH2Q9BUT1 245 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM185BQ9H7F4 350 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 TMCC3Q9ULS5 477 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 CLK1P49759 484 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 HMGA2P52926 109 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 DCST1Q5T197 706 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 VASNQ6EMK4 673 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 SLC7A13Q8TCU3 470 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 STK35Q8TDR2 534 aa25.05■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 TMEM239Q8WW34 195 aa25.05■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 SLC19A3Q9BZV2 496 aa25.05■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 FUT4P22083 530 aa25.04■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 TDGF1P3P51864 188 aa25.04■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 RRM2BQ7LG56 351 aa25.04■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 SARAFQ96BY9 339 aa25.04■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 EPYCQ99645 322 aa25.04■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC13O75165 2243 aa25.04■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 TFPIP10646 304 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 BCL2A1Q16548 175 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF730Q6ZMV8 503 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 SPRR3Q9UBC9 169 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 MED31Q9Y3C7 131 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 U3KQV3 271 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 OR14I1A6ND48 311 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 E2F6O75461 281 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 WISP2O76076 250 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 SFTPDP35247 375 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 LIMS1P48059 325 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 STARP49675 285 aa25.03■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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GIPC1-201ENST00000345425 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL15Q96M94 604 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 POTEKPQ9BYX7 375 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL4Q9C0H6 718 aa25.03■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 MED12Q93074 2177 aa25.02■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa25.02■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 A0A087WUU8 490 aa25.02■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa25.02■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GTH9 108 aa25.02■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 EGR4Q05215 589 aa25.02■■□□□ 1.6
GIPC1-201ENST00000345425 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa25.02■■□□□ 1.6
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