RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PCSK2P16519 638 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 F2RL1P55085 397 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 LTB4RQ15722 352 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HYLS1Q96M11 299 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HHATLQ9HCP6 504 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 RAB5BP61020 215 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 FRMD1Q8N878 549 aa9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 HTR1EP28566 365 aa9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 SERTM1A2A2V5 107 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HIDE1A8MVS5 230 aa9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 BORCS6Q96GS4 357 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SURF4O15260 269 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SEC14L2O76054 403 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NXPH2O95156 264 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HLCSP50747 726 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CLDN8P56748 225 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MZT1Q08AG7 82 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MOGQ16653 247 aa9.88□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 GPR26Q8NDV2 337 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CHST11Q9NPF2 352 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CD93Q9NPY3 652 aa9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 D6RAR5 112 aa9.87□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 CHATP28329 748 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HOXA9P31269 272 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GSK3AP49840 483 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GPR18Q14330 331 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MISPQ8IVT2 679 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FNDC9Q8TBE3 224 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MYADMQ96S97 322 aa9.87□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 MMP27Q9H306 513 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 IL26Q9NPH9 171 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GPR160Q9UJ42 338 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.87□□□□□ -0.83
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CLN8-201ENST00000331222 SLC6A8P48029 635 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 EMP3P54852 163 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CARD18P57730 90 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ACTBP60709 375 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ACTG1P63261 375 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 AIG1Q9NVV5 245 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RNLSQ5VYX0 342 aa9.87□□□□□ -0.83
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