RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 M0R3H8 397 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 GYG2O15488 501 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 NCK1P16333 377 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 CEACAM7Q14002 265 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SYT14P1Q58G82 188 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ULK3Q6PHR2 472 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 RPRMLQ8N4K4 120 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 MARVELD2Q8N4S9 558 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 OR6T1Q8NGN1 323 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 OR10D3Q8NH80 312 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 C3orf49Q96BT1 292 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 DDIT4LQ96D03 193 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 MCHR1Q99705 422 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 C12orf10Q9HB07 376 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SELENONQ9NZV5 590 aa24.06■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 WIPF3A6NGB9 483 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 TNFSF11O14788 317 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINA1P01009 418 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 LDLRP01130 860 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 IL2RAP01589 272 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 TFPIP10646 304 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 HTR2AP28223 471 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 RASSF2P50749 326 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 NUP107P57740 925 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 BNIP2Q12982 314 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 OR1Q1Q15612 314 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 DNAL1Q4LDG9 190 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 CARM1Q86X55 608 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 FAM156AQ8NDB6 213 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 TM9SF2Q99805 663 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF175Q9Y473 711 aa24.05■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 TENM4Q6N022 2769 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM229AB2RXF0 380 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 TPST2O60704 377 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF682O95780 498 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 PNMTP11086 282 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 CCNA2P20248 432 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SHC1P29353 583 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SSC4DQ8WTU2 575 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SLC47A1Q96FL8 570 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 OR5B2Q96R09 309 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 BTBD10Q9BSF8 475 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 PRR14Q9BWN1 585 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 COQ3Q9NZJ6 369 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 CLCF1Q9UBD9 225 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa24.04■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1B0GWA3 101 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM72A0PK05 275 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SLC22A20A6NK97 555 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 CXCL13O43927 109 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SYNGR4O95473 234 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 AGAP20933 346 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ADORA2A-AS1P86434 159 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF613Q6PF04 617 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 XKRXQ6PP77 449 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SEM1Q6ZVN7 128 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 FKBP9P1Q75LS8 142 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 P4HA3Q7Z4N8 544 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 POTEKPQ9BYX7 375 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SNX13Q9Y5W8 968 aa24.03■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 HSPB2A8KAH6 182 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 A8MVM7 634 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ZG16O60844 167 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 RAC3P60763 192 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 PON3Q15166 354 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 NPTX1Q15818 432 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 HSPB2Q16082 182 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ELOA3BQ3SY89 546 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ALG10BQ5I7T1 473 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ENTPD8Q5MY95 495 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 TMPPEQ6ZT21 453 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ELOA3Q8NG57 546 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 SLC38A4Q969I6 547 aa24.02■■□□□ 1.44
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms