RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302313.9

WDR48-201, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR48, Length 3,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-201ENST00000302313 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DEFA6Q01524 100 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MXD1Q05195 221 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 GAGE1Q13065 139 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MZT2AQ6P582 158 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TMEM25Q86YD3 366 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SVBPQ8N300 66 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ZNF480Q8WV37 535 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TMEM19Q96HH6 336 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 IL21Q9HBE4 155 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MED11Q9P086 117 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.66□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TMEM202A6NGA9 273 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 J3QRE1 110 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 HMGN4O00479 90 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 OR10H3O60404 316 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 LAMP2P13473 410 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MMP11P24347 488 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MSX1P28360 303 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 CD70P32970 193 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SMSP52788 366 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SOX8P57073 446 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TFF2Q03403 129 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 UBE2E3Q969T4 207 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RHBGQ9H310 441 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ISM1B1AKI9 464 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 B4GALT2O60909 372 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 AKR7A3O95154 331 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SOX14O95416 240 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 EGFP01133 1207 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 HIST1H2ABP04908 130 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 IL3P08700 152 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 S100A11P31949 105 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TBPL1P62380 186 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ERVK-25P63136 954 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RUNX3Q13761 415 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 GINS1Q14691 196 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DHCR24Q15392 516 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SNAPC1Q16533 368 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 C1QL4Q86Z23 238 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PXT1Q8NFP0 134 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 OTUB2Q96DC9 234 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MED8Q96G25 268 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 LRR1Q96L50 414 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MYADMQ96S97 322 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ZNF607Q96SK3 696 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MED17Q9NVC6 651 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 PISDQ9UG56 409 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.65□□□□□ -1.34
WDR48-201ENST00000302313 H3BN98 237 aa6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 RDH16O75452 317 aa6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 BCHEP06276 602 aa6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 EPHX1P07099 455 aa6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 PEPDP12955 493 aa6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 THBS2P35442 1172 aa6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 GCGRP47871 477 aa6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 CASP9P55211 416 aa6.65□□□□□ -1.35
WDR48-201ENST00000302313 CASP6P55212 293 aa6.65□□□□□ -1.35
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