RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP2K4P45985 399 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A8P48029 635 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MLLT10P55197 1068 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 Q0VFX4 171 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SYT14P1Q58G82 188 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 BORAQ6PGQ7 559 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51A7Q8NH64 312 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FANK1Q8TC84 345 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 COPS4Q9BT78 406 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SURF4O15260 269 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS10O43665 173 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CD63P08962 238 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ITPKBP27987 946 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TACR3P29371 465 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OTX2P32243 289 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RX1P51575 399 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SSPNQ14714 243 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SNAPC1Q16533 368 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NTRK2Q16620 822 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OCLNQ16625 522 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PGGHGQ32M88 737 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBED5Q49AG3 693 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK20Q8IZL9 346 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR119Q8TDV5 335 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FAR1Q8WVX9 515 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC9Q92623 222 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMCO6Q96DC7 493 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LHPPQ9H008 270 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CLN6Q9NWW5 311 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A10O95528 541 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHEP01854 428 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SOX3P41225 446 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LSAMPQ13449 338 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IL10RAQ13651 578 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ESX1Q8N693 406 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2T33Q8NG76 320 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF563Q8TA94 476 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LRR1Q96L50 414 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NPAS1Q99742 590 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 INMTO95050 263 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK1P06493 297 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 STSP08842 583 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PNMTP11086 282 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK4P11802 303 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ACVR2AP27037 513 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OAFQ86UD1 273 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ELOA3Q8NG57 546 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM163Q8TC26 289 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MUL1Q969V5 352 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPRBP23467 1997 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC14L2O76054 403 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ST3GAL4Q11206 333 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DNASE1L3Q13609 305 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CBFBQ13951 182 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 QPRTQ15274 297 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR141Q7Z602 305 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC15A4Q8N697 577 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms