RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A18Q9H1K4 315 aa10.06□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 AHSPQ9NZD4 102 aa10.06□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SH2B3Q9UQQ2 575 aa10.06□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 VWA8A3KMH1 1905 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ARRDC5A6NEK1 342 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OR52A4PA6NMU1 304 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SGCEO43556 437 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 PRNPP04156 253 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 MAPK8P45983 427 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 TNFRSF17Q02223 184 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 CST6Q15828 149 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 C4orf46Q504U0 113 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ABHD4Q8TB40 342 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 THAP4Q8WY91 577 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 C4orf36Q96KX1 117 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OR1F2PQ96R84 312 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 DMRT3Q9NQL9 472 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 GDE1Q9NZC3 331 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 AUP1Q9Y679 476 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 GOSR2O14653 212 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 IGF2P01344 180 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 MT-ND5P03915 603 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00271P0C7V0 271 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF35P13682 527 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ACTR1BP42025 376 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OR12D2P58182 307 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ACTR1AP61163 376 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 CTAG1AP78358 180 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SORDQ00796 357 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OR52L1Q8NGH7 329 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OR5M1Q8NGP8 315 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OR52I2Q8NH67 350 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 WNT2BQ93097 391 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 MACROD1Q9BQ69 325 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ASB6Q9NWX5 421 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 KLHL28Q9NXS3 571 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SDK2Q58EX2 2172 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 MEIS3P1A6NDR6 274 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 B4DGG1 531 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 GFYI3L273 518 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 PSMD9O00233 223 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 UGDHO60701 494 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 WDPCPO95876 746 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ATF1P18846 271 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 FUT1P19526 365 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ACADLP28330 430 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 NTSR1P30989 418 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 CDK5Q00535 292 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 TP53I3Q53FA7 332 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 C9orf64Q5T6V5 341 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 FAM71E1Q6IPT2 247 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 TAF8Q7Z7C8 310 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF614Q8N883 585 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 NANPQ8TBE9 248 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF480Q8WV37 535 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 GHSRQ92847 366 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 IRAK3Q9Y616 596 aa10.05□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 NCOR2Q9Y618 2525 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 FAM25EA8MYX2 175 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 AIPO00170 330 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 HMGN4O00479 90 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 PTP4A3O75365 173 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 FGF19O95750 216 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ECDO95905 644 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 CTSLP07711 333 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 MPC1LP0DKB6 136 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 C6P13671 934 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 SP140Q13342 867 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 EOGTQ5NDL2 527 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 TFAP2EQ6VUC0 442 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 USP53Q70EK8 1073 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 COMTD1Q86VU5 262 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 BMPERQ8N8U9 685 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OR2T33Q8NG76 320 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OR4Q3Q8NH05 313 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 ARRDC3Q96B67 414 aa10.04□□□□□ -0.8
CNGA3-201ENST00000272602 OTUB2Q96DC9 234 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms