RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004430.13

Clcn3-201, Transcript of H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clcn3, Length 4,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3-201ENSMUST00000004430 WacQ924H7 646 aa11.94□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Plxdc2Q9DC11 530 aa11.94□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Eif3fQ9DCH4 361 aa11.94□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tas2r103Q9JKA3 312 aa11.94□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ankrd12G5E893 2041 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm21117A0A087WPJ9 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm20820A0A087WPP3 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm20937A0A087WQA3 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm21258A0A087WQC7 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm21095A0A087WR14 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm20824A0A087WS97 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm29866A0A0A6YX04 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 A6H6Q4 206 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Bcl2l11O54918 196 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gna13P27601 377 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Bod1Q5SQY2 173 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rpa2Q62193 270 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc2a12Q8BFW9 622 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rxfp3Q8BGE9 472 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 ExogQ8C163 368 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pycr1Q922W5 309 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Get4Q9D1H7 327 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 TrilQ9DBY4 809 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Skint2A7XUX6 400 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Msl3l2G3X992 371 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm3099J3QPA5 205 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gas6Q61592 674 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pabpc2Q62029 628 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nsg1Q62092 185 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rims3Q80U57 307 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr70Q80ZX9 316 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfand1Q8BFR6 268 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Q8BPC6 396 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Sdhaf3Q8BQU3 125 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cep68Q8C0D9 733 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Las2Q8CB14 526 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 4921517D22RikQ8CET0 269 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tram1l1Q8QZR0 363 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr689Q8VG18 320 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1217Q8VGG1 304 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 AjubaQ91XC0 547 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Copz2Q9JHH9 205 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Plekhb1Q9QYE9 243 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm14085A2AWR5 660 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm9857F7CXR1 130 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm21812J3QN84 227 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vmn2r117K7N6V1 857 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zdhhc2P59267 366 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 AmbpQ07456 349 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Grhl3Q5FWH3 603 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam46cQ5SSF7 391 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fbxl4Q8BH70 621 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc6a17Q8BJI1 727 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Grb14Q9JLM9 538 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Apc2Q9Z1K7 2274 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Prr14lE9Q7C4 1971 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ndor1A2AI05 598 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Elfn2Q68FM6 823 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc22a20Q80UJ1 556 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem202Q80W35 275 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gemin8Q8BHE1 238 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 PcgF3Q8BTQ0 241 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Apoa5Q8C7G5 368 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 FcrlaQ920A9 352 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hint3Q9CPS6 165 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gde1Q9JL56 331 aa11.93□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gp6P0C191 313 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 PdxpP60487 292 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Drd2P61168 444 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Anxa11P97384 503 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ccdc190Q3URK1 288 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 ManeaQ6NXH2 462 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 PrlhrQ6VMN6 370 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr270Q7TS19 314 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hs6st2Q80UW0 612 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Galnt7Q80VA0 657 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Wfikkn1Q8R0S6 552 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 MtapQ9CQ65 283 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cyp2u1Q9CX98 530 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Prelid3bQ9CYY7 195 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dapl1Q9D757 107 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem131O70472 1877 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mrap2D3Z1Q2 207 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Grap2O89100 322 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 IghmP01872 454 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 St3gal3P97325 374 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Klhl21Q3U410 597 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mblac1Q8BWY4 260 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc25a21Q8BZ09 298 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Il23rQ8K4B4 644 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Noxo1Q8VCM2 349 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1048Q8VGS2 320 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rab28Q99KL7 221 aa11.92□□□□□ -0.5
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ccdc167Q9D162 97 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.4 ms