RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	NLK	Q9UBE8	527 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		12.08	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	HCN1	O60741	890 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINI2	O75830	405 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SBK2	P0C263	348 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF3	P17036	446 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PYCR1	P32322	319 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CD83	Q01151	205 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CAMK2B	Q13554	666 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MZT2A	Q6P582	158 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF613	Q6PF04	617 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PLET1	Q6UQ28	207 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SSX6	Q7RTT6	188 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB119	Q8N690	84 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SMPDL3B	Q92485	455 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RNF121	Q9H920	327 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SEC16A	O15027	2179 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0G2JNG1	304 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CHP2	O43745	196 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	AK1	P00568	194 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MT-ND5	P03915	603 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	S1PR1	P21453	382 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RAB25	P57735	213 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FZD2	Q14332	565 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	KIR2DS5	Q14953	304 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	QPRT	Q15274	297 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	WAC	Q9BTA9	647 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		12.07	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0G2JMP0	313 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0X1KG70	313 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PRG6	482 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FMO6P	O60774	539 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PTP4A3	O75365	173 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PAH	P00439	452 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MAOA	P21397	527 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	S100A1	P23297	94 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MAP2K3	P46734	347 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SYT9	Q86SS6	491 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RDH10	Q8IZV5	341 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR5J2	Q8NH18	312 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CENPX	A8MT69	81 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	TP53I3	Q53FA7	332 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RTL4	Q6ZR62	310 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	GATS	Q8NAP1	163 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	RASD1	Q9Y272	281 aa		12.06	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	IMPA2	O14732	288 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PEPD	P12955	493 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	HK1	P19367	917 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	LTBR	P36941	435 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF85	Q03923	595 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MANEA	Q5SRI9	462 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR4C3	Q8NH37	302 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K3	Q99759	626 aa		12.05	□□□□□ -0.48

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