RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672		G3V3Y1	287 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	AQP9	O43315	295 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	DDAH2	O95865	285 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TF	P02787	698 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	OSM	P13725	252 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	IL13RA1	P78552	427 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	KCND3	Q9UK17	655 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	BLACE	A4D250	179 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	NXPH2	O95156	264 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	IL4R	P24394	825 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	NFYB	P25208	207 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	HMGCL	P35914	325 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	CTRC	Q99895	268 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	AIG1	Q9NVV5	245 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TSPAN11	A1L157	253 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	KLF11	O14901	512 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	LTN1	O94822	1766 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	PEAK1	Q9H792	1746 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	OR5K3	A6NET4	321 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	OR10J4	P0C629	311 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	NAA40	Q86UY6	237 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	ST7L	Q8TDW4	575 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	FRS3	O43559	492 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	UGDH	O60701	494 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SHE	Q5VZ18	495 aa		13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672		A0A1W2PS29	197 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	ITGB2	P05107	769 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TGM1	P22735	817 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	CARD18	P57730	90 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	MPEG1	Q2M385	716 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TSSK2	Q96PF2	358 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	GAREM1	Q9H706	876 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	BIN3	Q9NQY0	253 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SUSD5	O60279	629 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC1A3	P43003	542 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TGM4	P49221	684 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	GPR176	Q14439	515 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TSSK4	Q6SA08	328 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	UHRF2	Q96PU4	802 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	BTBD2	Q9BX70	525 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	METTL9	Q9H1A3	318 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	CDK1	P06493	297 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	BCKDHB	P21953	392 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	PTGER1	P34995	402 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	CXCR4	P61073	352 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	BAX	Q07812	192 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	RNLS	Q5VYX0	342 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	LGALS12	Q96DT0	336 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	MOCOS	Q96EN8	888 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	PRRT1	Q99946	306 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	RDH14	Q9HBH5	336 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	PRSS56	P0CW18	603 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	NAGS	Q8N159	534 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	SURF4	O15260	269 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	GABRA4	P48169	554 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	BMX	P51813	675 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	MTCP1	P56278	107 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		12.99	□□□□□ -0.33

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