RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 TPD52L3Q96J77 140 aa11.5□□□□□ -0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 MYOTQ9UBF9 498 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 COPS7AQ9UBW8 275 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM166BA8MTA8 275 aa11.49□□□□□ -0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 CPMP14384 443 aa11.49□□□□□ -0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 MS4A12Q9NXJ0 267 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 REEP1Q9H902 201 aa11.49□□□□□ -0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MVJ9 347 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 CLPSP04118 112 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV3-11P04433 115 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
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