RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RNF220Q5VTB9 566 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF550Q7Z398 422 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GATSQ8NAP1 163 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ST8SIA1Q92185 356 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RCN3Q96D15 328 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TIMP4Q99727 224 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 F8P00451 2351 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NINQ8N4C6 2090 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GJE1A6NN92 205 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAAHO00519 579 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CCL21O00585 134 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LRRTM2O43300 516 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WISP2O76076 250 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IFNA14P01570 189 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LINGO3P0C6S8 592 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ME2P23368 584 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ELK4P28324 431 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PRKAR1BP31321 381 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HTR3AP46098 478 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UQCRFS1P47985 274 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SKP2Q13309 424 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAPK11Q15759 364 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ADRM1Q16186 407 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAPK14Q16539 360 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C3AR1Q16581 482 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 VMACQ2NL98 169 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RAET1LQ5VY80 246 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CD163Q86VB7 1156 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR10A6Q8NH74 314 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF563Q8TA94 476 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GPR119Q8TDV5 335 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAL2Q969L2 176 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZG16BQ96DA0 208 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UGT2B28Q9BY64 529 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MED17Q9NVC6 651 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 VDAC3Q9Y277 283 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MEMO1Q9Y316 297 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PDZD2O15018 2839 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 OR2M5A3KFT3 312 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CDHR4A6H8M9 788 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CFAP73A6NFT4 308 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM229AH3BQW9 127 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FXYD1O00168 92 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CYP7B1O75881 506 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AGFG2O95081 481 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EPPINO95925 133 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C8BP07358 591 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AGAP20933 346 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ACVR2AP27037 513 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms