RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MERTKQ12866 999 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR68Q15743 365 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF141Q15928 474 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT14P1Q58G82 188 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW9Q5XUX1 488 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A25Q6T423 547 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM108Q6UXF1 575 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF18AQ8NI77 898 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ST8SIA1Q92185 356 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL8AQ96BM9 186 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 MOAP1Q96BY2 351 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 DHRS9Q9BPW9 319 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 POU2F3Q9UKI9 436 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A15Q9Y619 301 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT2B1O00204 365 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CFLARO15519 480 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FCMRO60667 390 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 NTF4P34130 210 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SOAT1P35610 550 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 HBA1P69905 142 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 IL23RQ5VWK5 629 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2J2Q8N2K1 259 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 NATD1Q8N6N6 113 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF525Q8N782 197 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MECRQ9BV79 373 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SERINC1Q9NRX5 453 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC3Q9P0I2 261 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAT4BQ9UQ53 548 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF716A6NP11 495 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 NPHS1O60500 1241 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2B17O75795 530 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CSTAP01040 98 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PTAFRP25105 342 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CD40P25942 277 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DSCR9P59020 149 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 VLDLRP98155 873 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNEQ04844 493 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PDK3Q15120 406 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOA3BQ3SY89 546 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMKLAQ8IXN7 391 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MUC15Q8N387 334 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOA3Q8NG57 546 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 APH1AQ96BI3 265 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJA3Q96EY1 480 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ACER3Q9NUN7 267 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MKLN1Q9UL63 735 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CIB4A0PJX0 185 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DHRS4L1P0CG22 281 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MATN1P21941 496 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL14Q8N1E6 418 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM234Q8WY98 164 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP26Q9BV47 211 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R1B8 84 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 STX11O75558 287 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TFPIP10646 304 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PGCP20142 388 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPS1L1P21108 318 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ARRB2P32121 409 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 FABP6P51161 128 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB35Q15286 201 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 HOMEZQ8IX15 550 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CLECL1Q8IZS7 167 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL5BQ96KC2 179 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK17Q96T54 332 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC106Q9BWC9 280 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF350Q9GZX5 532 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PPCSQ9HAB8 311 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CTPS2Q9NRF8 586 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C417 338 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 AK1P00568 194 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A16P16260 332 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP9P55211 416 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK14Q16539 360 aa22.53■■□□□ 1.2
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