RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TEX261Q6UWH6 196 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 FAM131AQ6UXB0 335 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 AVL9Q8NBF6 648 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 OR6C4Q8NGE1 309 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 OR13C2Q8NGS9 318 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 PIGXQ8TBF5 258 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TMEM163Q8TC26 289 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 SLC37A2Q8TED4 501 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 KLHL28Q9NXS3 571 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 NLGN3Q9NZ94 848 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 STUB1Q9UNE7 303 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 U3KQ87 197 aa13.95□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TRAPPC2P0DI81 140 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TRAPPC2BP0DI82 140 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 DSG2Q14126 1118 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 ZNF79Q15937 498 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 IL20RBQ6UXL0 311 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 THSD4Q6ZMP0 1018 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 C17orf107Q6ZR85 190 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CHMP1BQ7LBR1 199 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 SIRT6Q8N6T7 355 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 COX18Q8N8Q8 333 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 PROKR2Q8NFJ6 384 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 OR6M1Q8NGM8 313 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GAL3ST3Q96A11 431 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 DIRAS2Q96HU8 199 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 MCOLN1Q9GZU1 580 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CDCP1Q9H5V8 836 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 MCUBQ9NWR8 336 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CLEC4AQ9UMR7 237 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TEX46H3BTG2 121 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 IMPA2O14732 288 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TMEM127O75204 238 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RFPL3O75679 317 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 SAGP10523 405 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TBXA2RP21731 343 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 NOS3P29474 1203 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RPS5P46782 204 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TATDN3Q17R31 274 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RPTNQ6XPR3 784 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CCDC190Q86UF4 302 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GPAT4Q86UL3 456 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TCTE3Q8IZS6 198 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GATSQ8NAP1 163 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GPR89AB7ZAQ6 455 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 I3L1I5 382 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 HMGN1P05114 100 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 ZGLP1P0C6A0 271 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GPR89BP0CG08 455 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 ST6GAL1P15907 406 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RORCP51449 518 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 WNT4P56705 351 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RUNX1T1Q06455 604 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TMEM64Q6YI46 380 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CCDC3Q9BQI4 270 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RNF121Q9H920 327 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 NDUFB11Q9NX14 153 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 ING3Q9NXR8 418 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CD207Q9UJ71 328 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 DTX4Q9Y2E6 619 aa13.94□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 UNC13CQ8NB66 2214 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GABRG2P18507 467 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 ZNF136P52737 540 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TSPAN31Q12999 210 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 OCLNQ16625 522 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 TMEM201Q5SNT2 666 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 SLC36A4Q6YBV0 504 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 ARL14Q8N4G2 192 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GABRG3Q99928 467 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 ZSCAN32Q9NX65 697 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 CASKO14936 926 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 PRODHO43272 600 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 F8A1P23610 371 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 APEX1P27695 318 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 PGDP52209 483 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 FXYD6P3P58550 94 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.93□□□□□ -0.18
CTIF-205ENST00000587860 SYT9Q86SS6 491 aa13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms