RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	NUDT7	P0C024	238 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	EPX	P11678	715 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	RYK	P34925	604 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	HTR3A	P46098	478 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	MAP2K6	P52564	334 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	GUCY1A3	Q02108	690 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	EPS8	Q12929	822 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	MYBPH	Q13203	477 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	LIN52	Q52LA3	116 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF563	Q8TA94	476 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	GALNT8	Q9NY28	637 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	IFT52	Q9Y366	437 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CFAP73	A6NFT4	308 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	EVPLL	A8MZ36	301 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	PGM3	O95394	542 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ARAF	P10398	606 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ETS2	P15036	469 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SLC7A1	P30825	629 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CD79B	P40259	229 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SLC1A3	P43003	542 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CPA2	P48052	419 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ARFIP2	P53365	341 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	KRTAP10-9	P60411	292 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	RNF220	Q5VTB9	566 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CGB2	Q6NT52	195 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	VRK2	Q86Y07	508 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SLC43A2	Q8N370	569 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	BBS10	Q8TAM1	723 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	RNF128	Q8TEB7	428 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	MAL2	Q969L2	176 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SLC35B4	Q969S0	331 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	DACH2	Q96NX9	599 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ADAM19	Q9H013	955 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	PROCR	Q9UNN8	238 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821		A0A1W2PNR3	127 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ANGPT2	O15123	496 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF208	O43345	1280 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CTAG2	O75638	210 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	PRKD3	O94806	890 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	GOSR1	O95249	250 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	UQCRB	P14927	111 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CTBP2	P56545	445 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SIRPA	P78324	504 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	SYT14P1	Q58G82	188 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	REEP3	Q6NUK4	255 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	FCRLA	Q7L513	359 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF550	Q7Z398	422 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	RETREG3	Q86VR2	466 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	C10orf111	Q8N326	155 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	RLIM	Q9NVW2	624 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GGA3-215	ENST00000582821	C5orf58	C9J3I9	102 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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