RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-208ENST00000578446 GPR137Q96N19 417 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 ZNF347Q96SE7 839 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 NPAS1Q99742 590 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 CHID1Q9BWS9 393 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 SERINC1Q9NRX5 453 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 RHCGQ9UBD6 479 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
USP22-208ENST00000578446 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 LINC01387J3KSC0 135 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 CHP2O43745 196 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SUSD5O60279 629 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SEMA7AO75326 666 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 FKBP6O75344 327 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ENTPD5O75356 428 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 WISP1O95388 367 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ACTL6AO96019 429 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 THRBP10828 461 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 CHMP24386 653 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SLC7A1P30825 629 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 MAGEA2P43356 314 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 GFRA1P56159 465 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 DLX5P56178 289 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 HSF1Q00613 529 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ST3GAL3Q11203 375 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 FGD3Q5JSP0 725 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 GHDCQ8N2G8 530 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ADAM19Q9H013 955 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 STOML1Q9UBI4 398 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 AP4S1Q9Y587 144 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SPTA1P02549 2419 aa9.64□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 NBEAQ8NFP9 2946 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 A0A1B0GTH9 108 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 GJE1A6NN92 205 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 H0YHG0 523 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 AQP7O14520 342 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 GNGT2O14610 69 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 FFAR1O14842 300 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ADAMDEC1O15204 470 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SEC14L5O43304 696 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 TIPRLO75663 272 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 CST1P01037 141 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 TFPIP10646 304 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 FCGR1AP12314 374 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 IL11P20809 199 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 PTNP21246 168 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 RRM2P31350 389 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SFTPDP35247 375 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 MLLT10P55197 1068 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SMIM11AP58511 58 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 TRAM2Q15035 370 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SYT14P1Q58G82 188 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 LILRA2Q8N149 483 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SLC38A4Q969I6 547 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 RELTQ969Z4 430 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 DDIT4LQ96D03 193 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 MPP4Q96JB8 637 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 C12orf10Q9HB07 376 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9.63□□□□□ -0.87
USP22-208ENST00000578446 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms