RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF681Q96N22 645 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ECSITQ9BQ95 431 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PINK1Q9BXM7 581 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 TRIM15Q9C019 465 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 NTMQ9P121 344 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.32□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ARPC2O15144 300 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SEC14L5O43304 696 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 KIAA0513O60268 411 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFS7O75251 213 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PPM1BO75688 479 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PSMG1O95456 288 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 KRT75O95678 551 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 GPR75O95800 540 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf47O95873 294 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 CGAP01215 116 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 DANCRP0C864 163 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 UMPSP11172 480 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 FCGR2AP12318 317 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A16P16260 332 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 GGT1P19440 569 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 NTSP30990 170 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 MPIP34949 423 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 MVDP53602 400 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 CTBP2P56545 445 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 RBBP4Q09028 425 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PLCXD2Q0VAA5 305 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SELPLGQ14242 412 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PON3Q15166 354 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SNCBQ16143 134 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 NNATQ16517 81 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 BCL2A1Q16548 175 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SGCBQ16585 318 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 GTDC1Q4AE62 458 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 BEND4Q6ZU67 534 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 DHFR2Q86XF0 187 aa8.31□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 OR2T12Q8NG77 320 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SFXN5Q8TD22 340 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 FIG4Q92562 907 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 MOAP1Q96BY2 351 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 NEURL3Q96EH8 262 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ADAM19Q9H013 955 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 OR10A5Q9H207 317 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 S100A14Q9HCY8 104 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.31□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 PGRMC2O15173 223 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 TNFRSF21O75509 655 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 GPIP06744 558 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 NAGAP17050 411 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 IGFBP5P24593 272 aa8.3□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 RGNQ15493 299 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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SMAD3-215ENST00000560424 SAXO2Q658L1 398 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 C18orf63Q68DL7 685 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 MICU2Q8IYU8 434 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 METTL25Q8N6Q8 603 aa8.3□□□□□ -1.08
SMAD3-215ENST00000560424 RNF148Q8N7C7 305 aa8.3□□□□□ -1.08
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