RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	APMAP	Q9HDC9	416 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	OR7A17	O14581	309 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	HTR3A	P46098	478 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CNIH2	Q6PI25	160 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		12.37	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	EDN3	P14138	238 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	MAOA	P21397	527 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CA5A	P35218	305 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SEMA3B	Q13214	749 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	GPR19	Q15760	415 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	PGGHG	Q32M88	737 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SBSN	Q6UWP8	590 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606		Q6ZSR9	355 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	MKX	Q8IYA7	352 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	EMC3	Q9P0I2	261 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SVIL	O95425	2214 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	BLACE	A4D250	179 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	DOK2	O60496	412 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ARSB	P15848	533 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ARL6IP1	Q15041	203 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CGB2	Q6NT52	195 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	AAED1	Q7RTV5	226 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	FRMD1	Q8N878	549 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TXNDC15	Q96J42	360 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	MED20	Q9H944	212 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	DCAF7	P61962	342 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	RBPJ	Q06330	500 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	MED25	Q71SY5	747 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF649	Q9BS31	505 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	MYH1	P12882	1939 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	HCRTR1	O43613	425 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ARAF	P10398	606 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	DPP4	P27487	766 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CLDN17	P56750	224 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	LTC4S	Q16873	150 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	NDNF	Q8TB73	568 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	PRR14	Q9BWN1	585 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	HDAC8	Q9BY41	377 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ARID1A	O14497	2285 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	MMP2	P08253	660 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SERPINA2	P20848	420 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	GABRA2	P47869	451 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	HTR5A	P47898	357 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	FAM57B	Q71RH2	274 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	NT5C3B	Q969T7	300 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CALHM2	Q9HA72	323 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	TNFSF4	P23510	183 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	CD27	P26842	260 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	HLA-DMA	P28067	261 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SSR4	P51571	173 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	PPP5C	P53041	499 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	COX15	Q7KZN9	410 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	SLC15A4	Q8N697	577 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	OR2T11	Q8NH01	316 aa		12.35	□□□□□ -0.43
ATE1-208	ENST00000540606	OR4K15	Q8NH41	348 aa		12.35	□□□□□ -0.43

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.4 ms