RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 LMO7DNF2Z398 122 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 F5H5T6 163 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 G3V2T6 193 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 LGALS8O00214 317 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ITM2AO43736 263 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PRAMEF10O60809 474 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NDUFS3O75489 264 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TNFAIP8O95379 198 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NPIPA8P0DM63 369 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PSKH1P11801 424 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CD19P15391 556 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CD1EP15812 388 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 AGXTP21549 392 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 DCKP27707 260 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CA5AP35218 305 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 THBS4P35443 961 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 AHRP35869 848 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 GJC1P36383 396 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TGM4P49221 684 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 KIAA1024LP59773 190 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NAE1Q13564 534 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MED22Q15528 200 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 GUK1Q16774 197 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ZBED5Q49AG3 693 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 KLHL22Q53GT1 634 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ZNF628Q5EBL2 1059 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 DNLZQ5SXM8 178 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ZNF573Q86YE8 665 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 RBFAQ8N0V3 343 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 SVOPLQ8N434 492 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 STX19Q8N4C7 294 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PHYHIPQ92561 330 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 AP3S1Q92572 193 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 RNFT2Q96EX2 444 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NSL1Q96IY1 281 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PRRC1Q96M27 445 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 C1orf50Q9BV19 199 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 LRRC61Q9BV99 259 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 STRADBQ9C0K7 418 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ZFP57Q9NU63 452 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TMEM248Q9NWD8 314 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PISDQ9UG56 409 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MIOXQ9UGB7 285 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 HS3ST2Q9Y278 367 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PQM1 296 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 URADA6NGE7 173 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 H7C2Y5 167 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 RGS10O43665 173 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 HCN1O60741 890 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 AVILO75366 819 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 IGLV3-25P01717 112 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PPBPP02775 128 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MT-ND2P03891 347 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 SLC35E2P0CK97 266 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NDUFB7P17568 137 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 IL1R2P27930 398 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CEACAM6P40199 344 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PSMB10P40306 273 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MAP3K8P41279 467 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CD81P60033 236 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PFN3P60673 137 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms