RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC13A4Q9UKG4 626 aa10.3□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 CLEC4AQ9UMR7 237 aa10.3□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ANGPT4Q9Y264 503 aa10.3□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PNR3 127 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PNV4 684 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 DYNC1I1O14576 645 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 AQP8O94778 261 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ARAFP10398 606 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ADH6P28332 368 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SEC24CP53992 1094 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 GNGT1P63211 74 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SELPLGQ14242 412 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 MAPK11Q15759 364 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 REEP3Q6NUK4 255 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF440Q8IYI8 595 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM71CQ8NEG0 241 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 TSPEARQ8WU66 669 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 C10orf82Q8WW14 230 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ROBO4Q8WZ75 1007 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PIF1Q9H611 641 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ACER3Q9NUN7 267 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PACSIN3Q9UKS6 424 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 IFT52Q9Y366 437 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 EMC9Q9Y3B6 208 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 DSPPQ9NZW4 1301 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 MPDZO75970 2070 aa10.29□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 BBIP1A8MTZ0 92 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 FBP2O00757 339 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAMDEC1O15204 470 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 FRS3O43559 492 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 EFNA2O43921 213 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC22O60826 627 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PGM3O95394 542 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 IL18BPO95998 194 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 TACR3P29371 465 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 NCALDP61601 193 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 TFF3Q07654 80 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 EPS8Q12929 822 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 RUNDC3AQ59EK9 446 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 REP15Q6BDI9 236 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 VWA1Q6PCB0 445 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 GRINAQ7Z429 371 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 GDF7Q7Z4P5 450 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 C10orf111Q8N326 155 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 DPP10Q8N608 796 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF511Q8NB15 262 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 C11orf65Q8NCR3 313 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF217Q8TC41 542 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF524Q96C55 264 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD27Q96NW4 1050 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF607Q96SK3 696 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SPATA9Q9BWV2 254 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 SRXN1Q9BYN0 137 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PIGMQ9H3S5 423 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 CTPS2Q9NRF8 586 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 CHRNA9Q9UGM1 479 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 PROCRQ9UNN8 238 aa10.28□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 ABCA12Q86UK0 2595 aa10.27□□□□□ -0.76
UBASH3B-208ENST00000533451 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CDHR4A6H8M9 788 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SULT2B1O00204 365 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 SERPINB7O75635 380 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CRHP06850 196 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 THBS1P07996 1170 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 BMP2P12643 396 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 ETS2P15036 469 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 GPX2P18283 190 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 CXCR1P25024 350 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 LSP1P33241 339 aa10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KIR2DL3P43628 341 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms