RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ATRX	P46100	2492 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF264	O43296	627 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	TIMP1	P01033	207 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ALOX5	P09917	674 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	CD1E	P15812	388 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	MMP11	P24347	488 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	TDO2	P48775	406 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	NUS1	Q96E22	293 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	PRRG1	O14668	218 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ARPC3	O15145	178 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	LAP3	P28838	519 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	LEP	P41159	167 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	RIPK4	P57078	832 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	SPIB	Q01892	262 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	CXCL13	O43927	109 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	OR10H3	O60404	316 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	MMP23A	O75900	390 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	IMPDH1	P20839	514 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	GABRR1	P24046	479 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	PRPH	P41219	470 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	SPAG6	O75602	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	ACTL6A	O96019	429 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	IGHG4	P01861	327 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	LGALS2	P05162	132 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	C1orf61	Q13536	156 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	PIGC	Q92535	297 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309		A0A1B0GUS0	222 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CASP4-208	ENST00000530309	EMC8	O43402	210 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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